Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ccdc47Q9D024 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ccdc47Q9D024 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms