Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms