Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mis18aQ9CZJ6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms