Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snf8Q9CZ28 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snf8Q9CZ28 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms