Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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