Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms