Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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