Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms