Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms