Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CQC3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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