Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rpl17Q9CPR4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rpl17Q9CPR4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Rpl17Q9CPR4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Rpl17Q9CPR4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Rpl17Q9CPR4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Rpl17Q9CPR4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Rpl17Q9CPR4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Rpl17Q9CPR4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Rpl17Q9CPR4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl17Q9CPR4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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