Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms