Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap4Q99P47 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms