Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms