Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms