Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a9Q99MR3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms