Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms