Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms