Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms