Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TriobpQ99KW3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms