Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SmagpQ99KC7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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SmagpQ99KC7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms