Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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