Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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