Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg2Q925E0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141 ms