Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spdl1Q923A2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms