Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms