Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin3bQ91ZU9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms