Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms