Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms