Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms