Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms