Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms