Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms