Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc12Q8R344 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms