Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms