Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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