Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Rnf183Q8QZS5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rnf183Q8QZS5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rnf183Q8QZS5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rnf183Q8QZS5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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