Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28aQ8K3Y3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms