Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms