Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Abcf3Q8K268 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcf3Q8K268 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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