Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms