Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700001C19RikQ8K168 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms