Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rasgef1bQ8JZL7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms