Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms