Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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SbsnQ8CIT9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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