Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Nedd4lQ8CFI0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Nedd4lQ8CFI0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nedd4lQ8CFI0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nedd4lQ8CFI0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nedd4lQ8CFI0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nedd4lQ8CFI0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nedd4lQ8CFI0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nedd4lQ8CFI0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nedd4lQ8CFI0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Nedd4lQ8CFI0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Nedd4lQ8CFI0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nedd4lQ8CFI0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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