Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms