Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef8Q8CE24 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms