Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms