Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RybpQ8CCI5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RybpQ8CCI5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms